大部分的腮腺炎患儿愈后良好,但家长不能掉以轻心,因为有个别患儿可能发生脑膜脑炎、心肌炎、肾炎等严重并发症。而少数女性患者可能引发卵巢炎,引起月经失调。个别男性患儿可能引发睾丸炎。病毒多数侵犯一侧睾丸,也会双侧睾丸同时受侵犯,睾丸肿胀、疼痛、阴囊红肿,或出现鞘膜积液,此时全身可出现寒颤、高热、恶心呕吐或者腹痛等症状。病程持续1-2周,症状才渐渐消退。
腮腺炎病毒会破坏睾丸组织,引起炎症反应甚至萎缩。如果两侧睾丸组织均受严重破坏,则可能导致男性生育能力下降甚至不育等严重后果。临床中不时可以见到这样的病例,有些男性不育者检查精液常规时,精液中精子弱少甚至找不到精子,经追问病史,才知道孩童时代曾患腮腺炎合并睾丸炎。因此,对腮腺炎不可麻痹大意。